M.S. geç 5.- erken 6. yüzyılda eski konut bölgesinde surların hemen kenarına inşa edilen bazilika planlı kilisenin ana mekanı (naos) iki sütun sırası ile üç nefe bölünmüştür. Kiliseye batıdaki merdivenden avlu (atrium), ön oda (narteks) ve ana mekana (naos) ulaşılmaktadır. Kilisenin kuzey yönünde teras duvarına gömülmüş on bir adet kemerli niş vardır.Vaftiz edilmemiş veya dine inanmayan kişilerin beklediği narteksin zemini geometrik bezekli mermer levhalarla (opus sectile), naos ve yan neflerin zeminleri ise mozaik ile kaplıdır. Mozaik üzerindeki iki yazıttan birincisinde: “Alypios yemine sadık kalarak kutsal yer için yaptırdı” ikincisinde ise: “Bilge (scholasticus) Satornilos bunu yeminine uygun olarak yaptı” ifadeleri yer almaktadır. Mozaik geometrik, bitkisel ve kuş betimlerinden oluşmaktadır. Apsis içinde papazların oturduğu sıralardan (synthronon) geriye sadece izler kalmıştır. Apsis önünde önemli kişilerin girebildiği bema bölümü mermer korkuluk (templon) ile  ana mekandan ayrılmıştır. 

M.S. 6. yüzyıla tarihlenen ikinci evrede naosdaki sütün sıraları kaldırılarak yerine duvarlar örülerek yan nefler kapalı odalar haline getirilmiştir. Bu evrede kuzeydeki nefin zemini büyük taş levhalar ile kaplanmıştır. Mimari ögeler yönünden oldukça zengin olan kilisenin sütün ve başlık gibi bölümleri başkent Konstantinopolis’dan (İstanbul) getirilmiştir.  Kilisenin duvarları kireç taşı plakalar ile kaplanmıştır.